自閉症の原因としては、遺伝子や染色体の異常による脳の器質的、機能的障害や脳内情報伝達物質代謝障害がいわれていますが、まだはっきりとした原因は分かっていません。
　自閉症は、親の養育態度や環境等、心理的な原因で生じる情緒障害ではありません。　

自閉症を根本から治すような治療法は現在のところありません。しかし、自閉症を理解し、適した接し方や環境を整えることでその症状を改善することはできます。また、薬によって一時的に症状を緩和させることもできます。その他にも心理的療法や行動的療法などが試みられています。　栄養研究の結果では、ビタミンＢ６とマグネシウムの組み合わせがよい結果を出しています。

現在、自閉症の発症率は、地域によっては1,000人中、最大6人に達している。自閉症は、コミュニケーションや社会との関わりに困難を伴うことを症状とし、数多くの自閉症患者は、腹部膨満感、腹痛や下痢にも苦しんでいる。

「自閉症の子供たちの腸内には、クロストリジウムという『悪玉』菌が通常よりも多いことが判明している。」こう説明するのは、レディング大学（英国）のGlenn Gibsonだ。そこで彼は、腸内のクロストリジウムのレベルを下げるプロバイオティクス補助食品によって自閉症の症状の一部を緩和させたいと考えている。

Gibsonは、クロストリジウムが自閉症の原因だとは言っていない。自閉症という複雑な疾患には、遺伝的要因と環境要因の両方が関係している可柏ｫが高く、今のところ、原因はわかっていないのだ。ただし、クロストリジウムが作り出す有毒な副産物が血液中に取り込まれ、それが脳に達し、自閉症の症状の一因となっている可能性はある。

「このような腸に関する症状に対応できる、というのが最も有望と考えられる結果だ。もし精神的症状の緩和にも役立てば、それはプラスαの効果となる。(Gibson)」